More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5665 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 		 437 aa  901    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  57.61 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  53.58 
 
 		 310 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  52.9 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  53 
 
 		 303 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  53 
 
 		 303 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.76 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.76 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.76 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.76 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.42 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.42 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  35.07 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.42 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 561 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.42 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.07 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  35.62 
 
 		 564 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.13 
 
 		 568 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.04 
 
 		 581 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  34.04 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.69 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.34 
 
 		 545 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  34.51 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.4 
 
 		 556 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  34.41 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  33.69 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.89 
 
 		 319 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  31.58 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  31.64 
 
 		 284 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  31.64 
 
 		 284 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  31.64 
 
 		 284 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.65 
 
 		 278 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  31.43 
 
 		 282 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  31.53 
 
 		 295 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  26.55 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  27.54 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  28.32 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  27.27 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.27 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  29.31 
 
 		 293 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  30.35 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  30.09 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  29.06 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.32 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  29.33 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  29.41 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  27.31 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.31 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.31 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  28.31 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  27.31 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  27.08 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  28.96 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  26.98 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  28.76 
 
 		 292 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  27.31 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.31 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  25.91 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.31 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.31 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  27.31 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  29.65 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  27.04 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  30.41 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  28.12 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  26.94 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  28.76 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  27.31 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  29.49 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  29.49 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  26.84 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  28.07 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  26.39 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  29.95 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  25.55 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1808  2-methylisocitrate lyase  29.49 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  29.49 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  29.49 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  27.76 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  29.03 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  27.37 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  26.62 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  27.76 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  29.28 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  27.69 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  26.99 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  25.38 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  26.47 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  30.96 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  26.18 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  27.93 
 
 		 287 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  26.54 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  29.68 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  29.46 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>