250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1956 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 		 278 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  36.08 
 
 		 564 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.65 
 
 		 581 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.66 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.08 
 
 		 562 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  37.65 
 
 		 578 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.08 
 
 		 561 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.08 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.17 
 
 		 568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.69 
 
 		 561 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  35.69 
 
 		 561 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.69 
 
 		 561 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.69 
 
 		 561 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.41 
 
 		 319 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  35.37 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  35.69 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.94 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.65 
 
 		 545 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.32 
 
 		 556 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.6 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  34.17 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.05 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.96 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  31.45 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  31.45 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.08 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  32.11 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1533  phosphoenolpyruvate phosphomutase  37.02 
 
 		 212 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  32.1 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  31.69 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  30.86 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  29.84 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  29.55 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  32.93 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  29.55 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  27.76 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 		 454 aa  82.4  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  28.51 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  27.76 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.35 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  27.35 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  27.35 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.35 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.35 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  27.46 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  27.35 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  31.05 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  30.16 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  28.83 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  31.4 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  35.71 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  30.23 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.35 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.35 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  31.45 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  28.11 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  31.01 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  26.64 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  31.01 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  30.83 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  30.63 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  29.73 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.82 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  31.98 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  30.86 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  31.55 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  28.86 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  28.88 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  29.17 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  30.45 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  25.31 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  27.8 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  30.11 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  30.59 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  30 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  29.96 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  29.77 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  30 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  25.19 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  25.56 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  25.19 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  33.16 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  29.77 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  29.77 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  29.39 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  29.96 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  29.39 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  29.39 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  29.39 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  29.39 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  29.08 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  29.77 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  27.15 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>