More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5999 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  921    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 		 581 aa  1181    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  921    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  921    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.69 
 
 		 562 aa  945    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  64.46 
 
 		 556 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  80.24 
 
 		 561 aa  924    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  81.47 
 
 		 562 aa  928    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  86.43 
 
 		 568 aa  990    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  97.69 
 
 		 578 aa  1126    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  82.83 
 
 		 562 aa  921    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  80.77 
 
 		 561 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  80.11 
 
 		 564 aa  929    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  80.59 
 
 		 561 aa  928    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  81.29 
 
 		 562 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  81.29 
 
 		 561 aa  932    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  80.59 
 
 		 561 aa  928    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  46.77 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  66.21 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  63.45 
 
 		 300 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  66.2 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  57.14 
 
 		 319 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.05 
 
 		 299 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  42.36 
 
 		 290 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  36.49 
 
 		 433 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.31 
 
 		 310 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.97 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.04 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  37.04 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  37.04 
 
 		 303 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  36.97 
 
 		 278 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  33.09 
 
 		 287 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  33.21 
 
 		 284 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  33.21 
 
 		 284 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  33.21 
 
 		 284 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  35.04 
 
 		 282 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  31.99 
 
 		 306 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.09 
 
 		 288 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  34.31 
 
 		 287 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.93 
 
 		 292 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  35.29 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  31.68 
 
 		 312 aa  125  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  31.47 
 
 		 285 aa  124  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  31.87 
 
 		 289 aa  124  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  30.85 
 
 		 311 aa  124  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  34.76 
 
 		 304 aa  123  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  27.84 
 
 		 289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  33.47 
 
 		 287 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  30.54 
 
 		 314 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  33.88 
 
 		 292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  36 
 
 		 306 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  31.1 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.55 
 
 		 302 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.55 
 
 		 302 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  34.55 
 
 		 302 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  33.58 
 
 		 304 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  34 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.15 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  34.15 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.55 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  34.15 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  34.15 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.55 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  30.79 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  29.11 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  34.26 
 
 		 305 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  32.09 
 
 		 302 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  30.32 
 
 		 274 aa  114  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  31.66 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  33.74 
 
 		 302 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  29.77 
 
 		 289 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  32.56 
 
 		 284 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  36.73 
 
 		 325 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  37.66 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  28.87 
 
 		 287 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  29.33 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  30.48 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  30.6 
 
 		 286 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  26.55 
 
 		 288 aa  111  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  31.32 
 
 		 301 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 302 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  28.85 
 
 		 298 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  28.87 
 
 		 293 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  36.69 
 
 		 307 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  30.27 
 
 		 295 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  30.37 
 
 		 295 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.24 
 
 		 289 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  31.72 
 
 		 297 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  30 
 
 		 312 aa  107  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  33.87 
 
 		 287 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  31.72 
 
 		 297 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  28.62 
 
 		 294 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  28.08 
 
 		 287 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  32.56 
 
 		 292 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  28.52 
 
 		 293 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  29.73 
 
 		 292 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  34.82 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>