More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1197 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  100 
 
 		 297 aa  613  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  88.47 
 
 		 296 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  87.46 
 
 		 296 aa  537  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  73.38 
 
 		 292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  72.01 
 
 		 291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  70.99 
 
 		 292 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  71.67 
 
 		 292 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  70.61 
 
 		 296 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  70.99 
 
 		 292 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  69.26 
 
 		 292 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  69.62 
 
 		 292 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  70.65 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  68.94 
 
 		 292 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  69.28 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  68.26 
 
 		 292 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  68.81 
 
 		 292 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  68.81 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  68.81 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  68.14 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  67.8 
 
 		 294 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  67.56 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  68.14 
 
 		 292 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  68.14 
 
 		 292 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  68.14 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  68.14 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  68.14 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  67.34 
 
 		 293 aa  414  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  65.45 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  65.45 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  64.43 
 
 		 295 aa  394  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4722  2-methylisocitrate lyase  63.64 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  64.97 
 
 		 298 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  64.63 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53940  2-methylisocitrate lyase  63.64 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  64.97 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  64.97 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2000  2-methylisocitrate lyase  63.95 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440629  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  64.29 
 
 		 298 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1808  2-methylisocitrate lyase  63.95 
 
 		 302 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  63.95 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  64.29 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  62.54 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  63.95 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  62.46 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  62.8 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  61.56 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  61.43 
 
 		 298 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  63.27 
 
 		 297 aa  384  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  63.27 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  61.9 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  61.43 
 
 		 298 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  62.12 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  62.12 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  62.12 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  61.07 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3275  methylisocitrate lyase  61.07 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  61.56 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  61.07 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  61.41 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  63.23 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  61.07 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  61.41 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2421  2-methylisocitrate lyase  65.66 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  62.46 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  60.41 
 
 		 298 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  61.07 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0403  2-methylisocitrate lyase  60.4 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  64 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  60.61 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  59.73 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  59.73 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5389  2-methylisocitrate lyase  62.12 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36576  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4842  2-methylisocitrate lyase  62.12 
 
 		 297 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  60.4 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1870  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0382  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1735  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1166  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2143  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0288  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  62.46 
 
 		 290 aa  359  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  62.46 
 
 		 290 aa  359  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0879  2-methylisocitrate lyase  60.07 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  57.82 
 
 		 299 aa  357  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  57.09 
 
 		 299 aa  353  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02718  2-methylisocitrate lyase  58.78 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6706  2-methylisocitrate lyase  61.09 
 
 		 297 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0506  2-methylisocitrate lyase  59.86 
 
 		 298 aa  341  9e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0571  2-methylisocitrate lyase  59.25 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  55.75 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  47.73 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  47.67 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  45.45 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  44.2 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  46.95 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  46.95 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>