More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2588 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  100 
 
 		 447 aa  889    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  51.49 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  44.37 
 
 		 464 aa  359  5e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  50.81 
 
 		 167 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  47.58 
 
 		 143 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  52.46 
 
 		 185 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  32.4 
 
 		 328 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 328 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.98 
 
 		 667 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  30.45 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.58 
 
 		 142 aa  123  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 320 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 328 aa  123  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  49.6 
 
 		 144 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  31.63 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  31.46 
 
 		 328 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.84 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  24.28 
 
 		 319 aa  119  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  31.31 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 151 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.7 
 
 		 132 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  49.59 
 
 		 187 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  45.45 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 133 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  30.3 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  46.46 
 
 		 127 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 328 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 329 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 338 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.62 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.54 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  44.25 
 
 		 116 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 139 aa  104  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.48 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.29 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  43.33 
 
 		 130 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  43.8 
 
 		 131 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.97 
 
 		 132 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  34.1 
 
 		 665 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.12 
 
 		 327 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 128 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  45.53 
 
 		 129 aa  99.8  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 356 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 667 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 357 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 667 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.1 
 
 		 331 aa  96.7  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 322 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 331 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 336 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.98 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  42.15 
 
 		 131 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  42.15 
 
 		 131 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 667 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  29.61 
 
 		 345 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.75 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.77 
 
 		 328 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 324 aa  94  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 338 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  37.24 
 
 		 344 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  26.38 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  39.84 
 
 		 132 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  30.18 
 
 		 379 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  30.33 
 
 		 325 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.28 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>