More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1809 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  57.36 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  57.54 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  57.54 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.67 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  57.54 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.98 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  57.98 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  56.92 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  56.92 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  56.92 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  57.1 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  56.92 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  56.92 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  56.92 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  56.31 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  56.31 
 
 		 332 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  56.31 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  56 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  56.31 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  56.48 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  56.48 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  56.62 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  51.23 
 
 		 329 aa  338  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  50 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  47.26 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  42.68 
 
 		 332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  36.86 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  34.23 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.66 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  31.25 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  33.2 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  27.13 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  26.45 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  26.18 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  32.3 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  35.45 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  26.32 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  24.55 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  31.89 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  27.15 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.76 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  25.97 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.44 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 667 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  23.01 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.05 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  29.06 
 
 		 451 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.46 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.93 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.24 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>