More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1826 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  100 
 
 		 326 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  40.42 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  39.94 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  37.8 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  37.8 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  36.45 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  36.9 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  35.03 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  35.03 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  35.03 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  36.06 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  35.03 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.06 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.76 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  35.03 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  34.95 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  34.35 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  34.04 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  34.43 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  34.43 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  34.65 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  36.86 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  34.35 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  35.98 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  32.33 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.13 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  30.07 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  30.87 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.28 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.28 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  25.95 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  23.84 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  28.71 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.6 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.23 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.23 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.75 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  27.7 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.75 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  29.68 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  26.54 
 
 		 451 aa  79.3  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  30.5 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.88 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.1 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.09 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.1 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  25.08 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2895  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.45 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  25.1 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  24.77 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  23.56 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>