More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1391 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  697    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  47.2 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  38.42 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  39.94 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  32.06 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  32.06 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  32.06 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  32.06 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  32.15 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  32.45 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.72 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.72 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  32.74 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  32.45 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  32.15 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  32.45 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  32.15 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 329 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  32.45 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  31.45 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  33.33 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  31.64 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.35 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  27.78 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.71 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.77 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.76 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  23.15 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.33 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  23.44 
 
 		 327 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.33 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  25 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  23.89 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.89 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.48 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  25.48 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.87 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  29.82 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 667 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25.32 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  24.71 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  22.32 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  22.92 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.65 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  29.53 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  22.48 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.83 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.83 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  25.7 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.83 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>