More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3322 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
328 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  79.2 
 
 
327 aa  564  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  52.13 
 
 
332 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  49.39 
 
 
325 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  49.09 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  48.94 
 
 
332 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  48.47 
 
 
332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  47.24 
 
 
326 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  47.89 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  47.89 
 
 
328 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  47.26 
 
 
324 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  47.59 
 
 
328 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  47.29 
 
 
328 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  47.29 
 
 
328 aa  309  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  48.32 
 
 
332 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  47.29 
 
 
328 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  48.32 
 
 
332 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  48.32 
 
 
344 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  47.71 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  47.71 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  46.65 
 
 
331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.65 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  47.29 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  48.01 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  48.01 
 
 
344 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.34 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  42.51 
 
 
329 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  35.31 
 
 
326 aa  203  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  38.28 
 
 
322 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  35 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
326 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.28 
 
 
318 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 
339 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
334 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
329 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
329 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 
338 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  31.09 
 
 
335 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  30.61 
 
 
345 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.23 
 
 
358 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  34.47 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  29.69 
 
 
320 aa  146  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
329 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
349 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.42 
 
 
333 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  32.64 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  29.46 
 
 
328 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  30.4 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.79 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 
329 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.7 
 
 
328 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
332 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.49 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
336 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.02 
 
 
327 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
354 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.02 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.02 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
352 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.02 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  31.02 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.02 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
334 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  32.6 
 
 
327 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
356 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.99 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
362 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
328 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
328 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
667 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.12 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.86 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.86 
 
 
349 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 
354 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  28.4 
 
 
348 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  34.8 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 
366 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
328 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>