More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4438 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
354 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  52.84 
 
 
334 aa  345  8e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  54.84 
 
 
358 aa  318  7e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  49.58 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  46.31 
 
 
349 aa  298  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  53.27 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  45.51 
 
 
345 aa  281  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  51.82 
 
 
352 aa  275  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  48.67 
 
 
358 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  50.46 
 
 
338 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  42.59 
 
 
331 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  41.57 
 
 
329 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  43.56 
 
 
329 aa  248  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  45.09 
 
 
338 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  40.81 
 
 
321 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  44.58 
 
 
342 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  41.77 
 
 
329 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  40.74 
 
 
356 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  45.68 
 
 
338 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  39.89 
 
 
357 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  41.11 
 
 
352 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  35.37 
 
 
327 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  39.75 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  42.9 
 
 
332 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  35.65 
 
 
328 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 
334 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  41.64 
 
 
341 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  42.51 
 
 
338 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  35.69 
 
 
329 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 
354 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  34.36 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  41.9 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 
327 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  35.22 
 
 
351 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  42.11 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  39.82 
 
 
338 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 
336 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  32.03 
 
 
374 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  32.11 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  36.96 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.71 
 
 
323 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  35.99 
 
 
356 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  34.58 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  48.72 
 
 
344 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.84 
 
 
349 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.84 
 
 
349 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  36.56 
 
 
338 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.18 
 
 
670 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
667 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
370 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
327 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  30.39 
 
 
361 aa  159  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
329 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
332 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  36.04 
 
 
328 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  36.13 
 
 
665 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
328 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.12 
 
 
359 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  35.29 
 
 
348 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 
381 aa  149  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  36.92 
 
 
334 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  29.82 
 
 
349 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 
383 aa  149  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.41 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.66 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
348 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
667 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
326 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  34.41 
 
 
360 aa  142  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 
667 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.75 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
667 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  34.83 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  40 
 
 
344 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.56 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.56 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.56 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  34.56 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  34.56 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.56 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 
328 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.5 
 
 
327 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  36.64 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  26.57 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  29.39 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  29.09 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  29.09 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>