More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0525 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  47.92 
 
 
335 aa  322  5e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  47.2 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  40.42 
 
 
326 aa  230  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  38.44 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  38.44 
 
 
332 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  37.98 
 
 
326 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 
332 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  33.63 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  34.93 
 
 
332 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  34.93 
 
 
332 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  34.83 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  34.93 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  33.63 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  34.93 
 
 
344 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  33.63 
 
 
328 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 
331 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.93 
 
 
331 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
328 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  33.03 
 
 
328 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 
328 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  33.03 
 
 
328 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  33.03 
 
 
334 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  33.03 
 
 
334 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.63 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  33.72 
 
 
332 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  33.93 
 
 
325 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
328 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
329 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
326 aa  126  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.83 
 
 
318 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  31.82 
 
 
320 aa  116  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  27.44 
 
 
320 aa  108  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  22.54 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  26.01 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.85 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.24 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.1 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.1 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.47 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.85 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.76 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.76 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.33 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.33 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.78 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.78 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  27.09 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  29.44 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.44 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  29.44 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.59 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.5 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  36.15 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  27.14 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.5 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  39.62 
 
 
416 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  27.85 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
332 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  26.36 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
667 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  26.27 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  32.37 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>