More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0163 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  100 
 
 		 320 aa  654    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.05 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  43.26 
 
 		 326 aa  265  8e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  37.27 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  30.34 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  29.49 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  29.49 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  29.49 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  28.81 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  29.15 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  28.81 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  29.15 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  33.2 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  28.81 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  28.81 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  28.47 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  28.14 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  28.14 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.25 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.25 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  29.32 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  30.87 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  28.76 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  31.82 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 354 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 		 329 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.31 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  26.97 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.45 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.34 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  22.87 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.27 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 357 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.27 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 359 aa  92.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 370 aa  92.4  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  25.79 
 
 		 451 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  26.62 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  30.81 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  23.62 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  29.18 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  24.42 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  25.36 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  25.36 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  25.36 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  25.36 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  25.36 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  23.26 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  24.82 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.2 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>