More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0125 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 360 aa  748    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.94 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  50.78 
 
 		 329 aa  359  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  43.48 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  42.86 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  41.25 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  29.79 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  34.23 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  32.53 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  33.74 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  32.97 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  31.75 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 335 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.37 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 		 667 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.07 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  33.86 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  35.11 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.68 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 338 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  32.04 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  27.3 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  29.69 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  35.25 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 667 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.73 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.69 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.55 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.55 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.73 
 
 		 328 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  34.05 
 
 		 665 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  36.14 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  33.97 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.4 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  34.85 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.35 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.35 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.35 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  34.35 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.35 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  33.33 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  31.82 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30 
 
 		 334 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.35 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  31.79 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  34.72 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>