More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0497 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  99.09 
 
 		 331 aa  683    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  99.4 
 
 		 331 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 		 331 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  75.77 
 
 		 326 aa  524  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  74.15 
 
 		 328 aa  502  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  73.15 
 
 		 332 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  73.85 
 
 		 328 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  73.85 
 
 		 328 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  73.54 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  73.54 
 
 		 328 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  73.54 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  73.23 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  71.91 
 
 		 344 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  71.91 
 
 		 344 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  73.23 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  73.23 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  71.91 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  71.6 
 
 		 332 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  71.6 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  69.3 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  69 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  57.98 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  56.17 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  52.47 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  46.93 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  46.65 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  44.98 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  36.06 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  34.93 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  34.12 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  34.56 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.62 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  29.25 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 329 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  28.39 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  31.67 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  26.67 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  27.57 
 
 		 379 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  28.53 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  24.32 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.17 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  31.75 
 
 		 359 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  28.25 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 352 aa  96.3  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  22.46 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.47 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 667 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  21.88 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  23.72 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  25 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  22.87 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.51 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.51 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 372 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  30.35 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 665 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.92 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  29.11 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  24.25 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>