More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3633 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  100 
 
 		 359 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.44 
 
 		 329 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 329 aa  196  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  34.65 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  35.31 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  32.6 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  30.18 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  33.22 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  40.96 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.83 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.83 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  41.71 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  33.46 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 667 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  33.69 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  29.97 
 
 		 388 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 667 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  30.84 
 
 		 331 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.04 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 332 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  27.89 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  30.57 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 667 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 667 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  28.35 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  28.08 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.47 
 
 		 670 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.25 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  35.39 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  36.07 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  30.27 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.25 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 327 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 665 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  28.83 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  26.44 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  27.79 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  26.18 
 
 		 451 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.44 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.26 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.51 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.08 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  32.99 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  27.08 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.96 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>