More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  705    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  46.67 
 
 
334 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  48.67 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  45.43 
 
 
358 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  45.64 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  45.56 
 
 
352 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  40.06 
 
 
349 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  44.1 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  39.94 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  41.36 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  41.54 
 
 
329 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  44.48 
 
 
379 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  42.33 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 
354 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 
321 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  38.97 
 
 
352 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  44.24 
 
 
338 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  42.72 
 
 
338 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  39.81 
 
 
331 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  35.15 
 
 
328 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  38.11 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  36.92 
 
 
327 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 
338 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  39.05 
 
 
341 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  33.64 
 
 
323 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  40.99 
 
 
334 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  40.37 
 
 
338 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  40.87 
 
 
333 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  43.12 
 
 
322 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
329 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
342 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 
327 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  38.82 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  40.8 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  45.23 
 
 
344 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.66 
 
 
324 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
321 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  30.49 
 
 
323 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
320 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.81 
 
 
361 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  30.4 
 
 
388 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  29.84 
 
 
374 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
667 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.96 
 
 
331 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  34.26 
 
 
328 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  34.15 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.79 
 
 
359 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  36.75 
 
 
334 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  32.33 
 
 
351 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 
356 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  30.29 
 
 
349 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  34.46 
 
 
328 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
328 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.83 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 
338 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
348 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 
383 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.3 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
667 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.3 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.26 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  34.15 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
327 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
667 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.95 
 
 
327 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.95 
 
 
327 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.95 
 
 
327 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  33.95 
 
 
327 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.95 
 
 
327 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
381 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  33.72 
 
 
348 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 
667 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  26.81 
 
 
332 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
381 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  25.54 
 
 
319 aa  122  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
665 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
328 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.44 
 
 
327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.86 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  27.6 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.06 
 
 
670 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
332 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
332 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
330 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>