More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4661 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  700    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  73.68 
 
 
362 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  94.09 
 
 
344 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  49.42 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  50.58 
 
 
329 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  49.41 
 
 
341 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  44.77 
 
 
331 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  42.06 
 
 
321 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 
329 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  41.98 
 
 
332 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  42.69 
 
 
346 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  46.46 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  37.57 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  43.02 
 
 
332 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  40.52 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  38.19 
 
 
327 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  39.36 
 
 
334 aa  225  9e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  42.44 
 
 
334 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  39.09 
 
 
356 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  47.94 
 
 
322 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  42.86 
 
 
379 aa  222  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  35.09 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  41.4 
 
 
338 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  42.98 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  40.11 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  41.31 
 
 
338 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  40.82 
 
 
333 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  40.58 
 
 
342 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  39.77 
 
 
358 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  40.41 
 
 
352 aa  203  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  42.49 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 
349 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  36.52 
 
 
336 aa  195  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.66 
 
 
354 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  40 
 
 
358 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  41.69 
 
 
354 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  39.36 
 
 
320 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  34.21 
 
 
345 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  32.94 
 
 
323 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  33.17 
 
 
388 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
326 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  33.52 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.21 
 
 
349 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.21 
 
 
349 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  37.21 
 
 
335 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 
356 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.37 
 
 
359 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
667 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  38.37 
 
 
338 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  32.31 
 
 
374 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.88 
 
 
351 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.12 
 
 
324 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.74 
 
 
323 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
370 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.99 
 
 
319 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  28.57 
 
 
361 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
667 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
667 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  33.42 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.24 
 
 
667 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  34.86 
 
 
334 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  34.01 
 
 
328 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
327 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.99 
 
 
670 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
328 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.8 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  34.01 
 
 
328 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 
328 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  38.82 
 
 
665 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  37.65 
 
 
344 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  31.99 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
328 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.45 
 
 
327 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 
383 aa  126  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  26.4 
 
 
342 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 
326 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 
332 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26 
 
 
342 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
332 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  27.09 
 
 
332 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
348 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
360 aa  123  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  36.71 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  32.3 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  32.3 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  32.3 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  35.63 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  31.91 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  39.13 
 
 
327 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  31.91 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  34.41 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>