More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3164 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
327 aa  683    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  79.2 
 
 
328 aa  564  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  54.29 
 
 
332 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  49.85 
 
 
332 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  50.61 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  50.61 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  50 
 
 
332 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  51.53 
 
 
325 aa  331  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  49.54 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  49.54 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  49.54 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  49.54 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  49.54 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  48.8 
 
 
332 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  48.8 
 
 
344 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  49.24 
 
 
328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  49.54 
 
 
334 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  48.8 
 
 
344 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  49.54 
 
 
334 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  49.54 
 
 
328 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3518  putative oxidoreductase YgjR  48.49 
 
 
332 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  hitchhiker  0.000171181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3484  putative oxidoreductase YgjR  48.49 
 
 
332 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  46.93 
 
 
331 aa  318  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.93 
 
 
331 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.63 
 
 
331 aa  316  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  46.18 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  40.34 
 
 
322 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1826  dehydrogenase related protein  34.97 
 
 
326 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0525  dehydrogenase  35.44 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
326 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.87 
 
 
358 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
334 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.27 
 
 
318 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1391  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
339 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
329 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  31.86 
 
 
335 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 
329 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
329 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
329 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
349 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  33.43 
 
 
379 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 
338 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  31 
 
 
328 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
327 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  28.01 
 
 
345 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
321 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  29.38 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl208  oxioreductase  33.44 
 
 
320 aa  145  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.168216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
352 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  30.93 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.21 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  30.33 
 
 
324 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 
327 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  30.54 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 
332 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
342 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  29.08 
 
 
351 aa  126  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.63 
 
 
359 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
328 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  29.46 
 
 
348 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
341 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
354 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
327 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
346 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  29.64 
 
 
328 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  29.64 
 
 
328 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  30 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
327 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  30 
 
 
327 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
332 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  27.08 
 
 
388 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
327 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
370 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  34.8 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  35.09 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
334 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 
394 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
667 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>