More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6528 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  93.7 
 
 
667 aa  1294    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
667 aa  1359    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  76.16 
 
 
667 aa  1072    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  47.98 
 
 
667 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  44.66 
 
 
665 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.25 
 
 
670 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  41.19 
 
 
665 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  46.61 
 
 
338 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3897  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
328 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3216  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
320 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1199  aldo/keto reductase  38.69 
 
 
316 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  38.37 
 
 
330 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 
329 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.84 
 
 
342 aa  179  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  30.47 
 
 
342 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 
329 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
349 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.41 
 
 
334 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 
354 aa  167  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 
331 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  34.78 
 
 
379 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
338 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
329 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  33.21 
 
 
320 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
327 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 
321 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
332 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 
352 aa  154  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 
346 aa  153  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  32.17 
 
 
334 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 
334 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  29.71 
 
 
328 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
329 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 
352 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 
321 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 
344 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  28.81 
 
 
349 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  33.58 
 
 
343 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.39 
 
 
329 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.63 
 
 
338 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.72 
 
 
358 aa  144  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.44 
 
 
359 aa  144  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.05 
 
 
333 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  33.91 
 
 
338 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  31.78 
 
 
331 aa  140  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
338 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  32.83 
 
 
341 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 
322 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
362 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
328 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.22 
 
 
328 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.96 
 
 
323 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 
323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.82 
 
 
324 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.61 
 
 
319 aa  134  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 
357 aa  132  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  36.77 
 
 
326 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
345 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
322 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
342 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
324 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
332 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
356 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
337 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2027  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
337 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.53 
 
 
327 aa  125  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
327 aa  124  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
327 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
336 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  29.82 
 
 
388 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 
329 aa  123  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  30.03 
 
 
328 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  31.87 
 
 
328 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
354 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.23 
 
 
349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
360 aa  122  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  26.05 
 
 
361 aa  121  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.03 
 
 
328 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.23 
 
 
349 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 
335 aa  121  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  29.15 
 
 
342 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
332 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
342 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  28.33 
 
 
351 aa  120  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.73 
 
 
328 aa  120  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  29.12 
 
 
330 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 
356 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  28.95 
 
 
328 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
345 aa  118  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 
328 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
328 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
328 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  33.11 
 
 
312 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>