More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2277 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  59.64 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.99 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  31.78 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 667 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 667 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 667 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  24.63 
 
 		 667 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  26.28 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  35.48 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 665 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.09 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  23.35 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  29.26 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  25.15 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  23.78 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.43 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.5 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.61 
 
 		 670 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  25 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  27.92 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  26.78 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.47 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.47 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  23.4 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.43 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  28.42 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.23 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.26 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.72 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.55 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  29.08 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  27.81 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  23.36 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  22.32 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  26.59 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  25.26 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  28.36 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  29.51 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.25 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  34.58 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  23.02 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.41 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  23.81 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>