More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4657 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
366 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  67.42 
 
 
382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  50.41 
 
 
374 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  54.47 
 
 
384 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  48.47 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  42.71 
 
 
382 aa  285  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  40.63 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  42.09 
 
 
380 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  40.11 
 
 
383 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  43.39 
 
 
382 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 
385 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  39.21 
 
 
384 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  40.05 
 
 
384 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  38.1 
 
 
381 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  39.2 
 
 
381 aa  258  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 
377 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  39.15 
 
 
384 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  37.17 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  38.04 
 
 
390 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  39.15 
 
 
385 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  36.81 
 
 
379 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
390 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
380 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.76 
 
 
381 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  34.73 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  34.46 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 
381 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  33.51 
 
 
393 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
384 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.74 
 
 
419 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  36.41 
 
 
386 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
378 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 
381 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.47 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  33.51 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  31.37 
 
 
376 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 
378 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  35.04 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
399 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.86 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.86 
 
 
346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 
394 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  34.72 
 
 
388 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  37.04 
 
 
396 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 
390 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 
371 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
381 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 
376 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
380 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  32.16 
 
 
393 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 
364 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  33.07 
 
 
387 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  33.23 
 
 
377 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  37.77 
 
 
393 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
373 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
378 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.04 
 
 
369 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  34.85 
 
 
371 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 
373 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 
378 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 
377 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  32.45 
 
 
377 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.45 
 
 
377 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
388 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  35.15 
 
 
373 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
377 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  33.22 
 
 
377 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 
378 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 
385 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 
389 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 
377 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
377 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  33.89 
 
 
391 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 
397 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
377 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
395 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
376 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
396 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  32.28 
 
 
396 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  30.05 
 
 
378 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 
397 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 
390 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
382 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  31.37 
 
 
371 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 
387 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  31.37 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
394 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  36.49 
 
 
418 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
377 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 
373 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  31.3 
 
 
384 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
359 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  35.34 
 
 
398 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
371 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 
403 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>