More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5058 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 377 aa  784    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  69.95 
 
 		 378 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  59.95 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  59.84 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  54.23 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  54.93 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  52.53 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  54.09 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  55.79 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  54.4 
 
 		 394 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  53.6 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  49.61 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  51.22 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  48.94 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  50.8 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  48.41 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.4 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  50.53 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  50.13 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.94 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  49.6 
 
 		 390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  48.54 
 
 		 377 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  47.91 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  48.13 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  49.2 
 
 		 371 aa  359  5e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  49.34 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  48.93 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  45.99 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  48.41 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  47.62 
 
 		 395 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.7 
 
 		 346 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  45.74 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  47.06 
 
 		 378 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  45.72 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  46.15 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  44.59 
 
 		 383 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  44.47 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  48.4 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 381 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  42.71 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.7 
 
 		 378 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  41.16 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  41.95 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  44.68 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  37.77 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  35.56 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  35.98 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  36.1 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  34.76 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  35.71 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.22 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.48 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  35.45 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  34.66 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  35.19 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  34.66 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.5 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 384 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 352 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.32 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.08 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.96 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>