More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3830 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  100 
 
 		 393 aa  809    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  74.94 
 
 		 395 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  75.19 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  72.05 
 
 		 390 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  72.05 
 
 		 390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  71.83 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  69.8 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.39 
 
 		 346 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  65.8 
 
 		 381 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  65.8 
 
 		 381 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  65.01 
 
 		 381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  60.8 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  65.46 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  58.44 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  55.91 
 
 		 383 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  55.26 
 
 		 384 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  58.47 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  57.3 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  54.23 
 
 		 390 aa  421  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  52.91 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  51.06 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  50.4 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  50.67 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  49.08 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  47.88 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  48.81 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  50.8 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  49.34 
 
 		 373 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  47.48 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  47.48 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  47.33 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  46.86 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.26 
 
 		 380 aa  352  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  46.42 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  47.48 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  43.77 
 
 		 381 aa  346  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.64 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  50.93 
 
 		 364 aa  339  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  46.01 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  45.64 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  44.87 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  44.56 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  42.78 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  40.48 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  38.96 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  36.68 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.44 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  40.64 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  39.79 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  40.1 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.87 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.8 
 
 		 377 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  39.9 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  40.05 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.89 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  40.05 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  39.79 
 
 		 390 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.62 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  37.4 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  42.27 
 
 		 407 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.66 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.8 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 383 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 384 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.45 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  29.09 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 378 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 388 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  29.3 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.36 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  30.26 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>