More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0728 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
364 aa  749    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  47.24 
 
 
381 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  39.11 
 
 
390 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  36.68 
 
 
393 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  36.05 
 
 
394 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  37.17 
 
 
395 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  37.27 
 
 
395 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.8 
 
 
390 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 
387 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  36.29 
 
 
394 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  37.77 
 
 
377 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  35.16 
 
 
396 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  34.4 
 
 
381 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 
380 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  34.99 
 
 
385 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  36.59 
 
 
389 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.36 
 
 
346 aa  252  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.7 
 
 
391 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.13 
 
 
381 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  34.4 
 
 
381 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  36.87 
 
 
378 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 
394 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  35.6 
 
 
393 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
399 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  34.76 
 
 
376 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  34.3 
 
 
378 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
387 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
385 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  32.71 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 
390 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 
384 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  33.42 
 
 
371 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 
391 aa  229  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 
382 aa  229  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 
373 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 
381 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.21 
 
 
389 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  30.69 
 
 
373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  30.42 
 
 
396 aa  219  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  30.39 
 
 
390 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  30.39 
 
 
389 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  30.65 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  30.46 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
390 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
390 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
364 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  28.07 
 
 
377 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
384 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 
390 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
407 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  29.81 
 
 
377 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 
390 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  29.17 
 
 
390 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  30.65 
 
 
390 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
390 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
393 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
388 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
378 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
392 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 
375 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
385 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 
384 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
384 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.49 
 
 
386 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
383 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  24.78 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.58 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  24.36 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.34 
 
 
369 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 
393 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  27.05 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 
390 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
380 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
382 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 
397 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
409 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
398 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>