More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1354 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
398 aa  802    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  74.36 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  73.78 
 
 
398 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  68.27 
 
 
396 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  66.16 
 
 
397 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  68.13 
 
 
388 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  65.01 
 
 
386 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  68.05 
 
 
389 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  64.16 
 
 
378 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  61.04 
 
 
419 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  64.71 
 
 
409 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  63.04 
 
 
409 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  60.88 
 
 
397 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  62.99 
 
 
413 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  56.1 
 
 
387 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  55.84 
 
 
387 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  54.97 
 
 
378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  52.88 
 
 
403 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  53.07 
 
 
387 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  54.91 
 
 
379 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  48.29 
 
 
385 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  54.52 
 
 
418 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  52.53 
 
 
398 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  50.92 
 
 
387 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  45.45 
 
 
396 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  42.49 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  44.99 
 
 
388 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  44.82 
 
 
385 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  48.31 
 
 
371 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  46.41 
 
 
378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  42.67 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  46.25 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  42.01 
 
 
376 aa  300  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  45.83 
 
 
382 aa  298  8e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  41.73 
 
 
390 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  42.74 
 
 
369 aa  285  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  42.71 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  42.82 
 
 
390 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  38.9 
 
 
388 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  37.4 
 
 
378 aa  255  8e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  37.87 
 
 
376 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  37.9 
 
 
371 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  40 
 
 
386 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  38.44 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  37.63 
 
 
371 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  37.95 
 
 
394 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.79 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  36.79 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  36.79 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.49 
 
 
377 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  38.04 
 
 
359 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  40.63 
 
 
373 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  35.75 
 
 
377 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 
377 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 
373 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 
376 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 
395 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
389 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  36.62 
 
 
382 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
371 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  37.21 
 
 
369 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  36.7 
 
 
372 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 
380 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  35.08 
 
 
396 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  34.48 
 
 
367 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  35.9 
 
 
367 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.6 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  34.54 
 
 
388 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
398 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.43 
 
 
374 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 
384 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  34.02 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 
382 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.87 
 
 
386 aa  173  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 
384 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 
393 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
381 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 
372 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
381 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  34.36 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  35.31 
 
 
392 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
394 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
383 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.41 
 
 
382 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 
382 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
377 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 
384 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 
378 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 
380 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  32.45 
 
 
383 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
384 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 
371 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>