More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0572 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  809    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  78.71 
 
 
403 aa  614  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  78.88 
 
 
418 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  68.55 
 
 
379 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  59.9 
 
 
386 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  56.91 
 
 
378 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  59.58 
 
 
388 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  57.48 
 
 
387 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  54.99 
 
 
396 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  54.69 
 
 
419 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  52.56 
 
 
397 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  53.09 
 
 
397 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  53.94 
 
 
409 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  52.55 
 
 
378 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  53.3 
 
 
413 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  52.53 
 
 
398 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  50.27 
 
 
387 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  55.03 
 
 
389 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  49.74 
 
 
387 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  54.83 
 
 
398 aa  352  5e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  53.26 
 
 
409 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  48.95 
 
 
387 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  45.16 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  48.65 
 
 
378 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  46.63 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  50 
 
 
371 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  46.81 
 
 
382 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  45.11 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  47.68 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  47.85 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  46.7 
 
 
369 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  44.03 
 
 
387 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  43.19 
 
 
388 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  39.74 
 
 
386 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  40 
 
 
393 aa  276  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  40.37 
 
 
385 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  38.26 
 
 
388 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  38.9 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  42.56 
 
 
390 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  38.5 
 
 
377 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  37.91 
 
 
377 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  39.67 
 
 
376 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  40.27 
 
 
386 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  38.96 
 
 
371 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  38.96 
 
 
371 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  35.87 
 
 
378 aa  226  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.09 
 
 
377 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  37.09 
 
 
377 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  39.78 
 
 
376 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 
377 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  37.09 
 
 
377 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 
359 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  37.37 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 
371 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  35.11 
 
 
391 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  40.49 
 
 
373 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
371 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 
398 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.44 
 
 
369 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 
395 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
394 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  39.02 
 
 
372 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.6 
 
 
382 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 
380 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.87 
 
 
382 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 
372 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  36.69 
 
 
367 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
397 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  30.4 
 
 
374 aa  173  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  35.74 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.79 
 
 
366 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
389 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
389 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  30.25 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
385 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  33.92 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 
393 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 
409 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
384 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
377 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
381 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
381 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 
372 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 
381 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 
370 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
380 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  32.73 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.04 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
382 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.87 
 
 
386 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
378 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>