More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0970 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  83.2 
 
 		 386 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 385 aa  803    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  74.06 
 
 		 393 aa  620  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  46.35 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  46.35 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  47.03 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  46.15 
 
 		 378 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  43.58 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  46.15 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  45.77 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  45.64 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  41.99 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  44.24 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  42.43 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  45.04 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  44.82 
 
 		 398 aa  292  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  42.78 
 
 		 396 aa  288  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  42.18 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  44.13 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  39.03 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  39.79 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  39.04 
 
 		 376 aa  281  9e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  44.53 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  40.32 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  40.43 
 
 		 371 aa  278  9e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  39.19 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  41.14 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  39.03 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  42.63 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  39.69 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  39.95 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  40.37 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  40.91 
 
 		 418 aa  255  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 		 377 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  39.9 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  37.5 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  35.22 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  33.69 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  33.42 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  31.73 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  34.21 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  33.72 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.87 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  29.87 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.02 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 374 aa  170  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.12 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.59 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  33.22 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 372 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.27 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.47 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.2 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>