More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3435 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  83.73 
 
 
381 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
381 aa  797    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  58.59 
 
 
385 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  52.88 
 
 
384 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  53.02 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  52.23 
 
 
382 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  48.03 
 
 
384 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  47.24 
 
 
383 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  47.24 
 
 
383 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  46.17 
 
 
380 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  45.81 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  46.49 
 
 
384 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  42.89 
 
 
386 aa  325  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  40.65 
 
 
390 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  39.2 
 
 
366 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
394 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 
384 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 
382 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 
381 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.32 
 
 
381 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 
381 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  30.02 
 
 
394 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  32.43 
 
 
396 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
377 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.95 
 
 
346 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.95 
 
 
390 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
399 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
377 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.87 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  31.36 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  30.1 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
394 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 
388 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.79 
 
 
386 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 
384 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
378 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.61 
 
 
387 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
376 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.57 
 
 
377 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  31.57 
 
 
377 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  31.57 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
390 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.48 
 
 
369 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  30.27 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  30.85 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  29.15 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
388 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
378 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
390 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
376 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
397 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 
378 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
390 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
395 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 
378 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
376 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
396 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.59 
 
 
397 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.14 
 
 
379 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  29.1 
 
 
376 aa  155  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 
376 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  32.31 
 
 
373 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
395 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  31.04 
 
 
373 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.41 
 
 
371 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
387 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.81 
 
 
382 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
391 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
377 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.16 
 
 
371 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 
384 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
382 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
378 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
389 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
387 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.46 
 
 
349 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.46 
 
 
349 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
393 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 
409 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  27.14 
 
 
377 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.79 
 
 
382 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>