More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2765 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
393 aa  800    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.74 
 
 
390 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  48.06 
 
 
390 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  47.67 
 
 
396 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  45.93 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  44.62 
 
 
393 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  46.72 
 
 
383 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.85 
 
 
346 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  47.04 
 
 
381 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  41.47 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  46.61 
 
 
387 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  45.45 
 
 
381 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.45 
 
 
381 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  43.32 
 
 
394 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  44.06 
 
 
378 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  44.12 
 
 
381 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  44.36 
 
 
395 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  43.23 
 
 
395 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  43.82 
 
 
390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 
387 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  40.63 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  41.47 
 
 
373 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 
385 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  40.21 
 
 
394 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  42.74 
 
 
391 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  39.63 
 
 
385 aa  266  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.4 
 
 
391 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  37.53 
 
 
387 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  45.1 
 
 
390 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  41.99 
 
 
393 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  37.97 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 
382 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 
377 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  38.54 
 
 
389 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  43.01 
 
 
364 aa  245  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  38.79 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  35.82 
 
 
395 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  37.57 
 
 
390 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 
396 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 
380 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  35.54 
 
 
376 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  35.88 
 
 
373 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
381 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.87 
 
 
390 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  37.3 
 
 
390 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  37.3 
 
 
390 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  34.13 
 
 
377 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.7 
 
 
390 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
390 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  35.32 
 
 
396 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 
390 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 
390 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 
390 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
377 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  32 
 
 
377 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
390 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  34.04 
 
 
377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.73 
 
 
389 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.76 
 
 
389 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  33.84 
 
 
392 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
388 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
407 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 
390 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
364 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
375 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 
385 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.16 
 
 
366 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 
378 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 
374 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
381 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
381 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
382 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 
382 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
384 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
384 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.57 
 
 
386 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
384 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
394 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.58 
 
 
380 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
382 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
384 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  34.56 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 
390 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
385 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 
398 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
378 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.03 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  29.36 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.05 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.05 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  23.86 
 
 
378 aa  94  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
388 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>