More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3196 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 392 aa  816    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  59.08 
 
 		 389 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  58.57 
 
 		 389 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  57.29 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  57.54 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  55.24 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  56.78 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  55.75 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  54.22 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  55.75 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  37.11 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  37.73 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  36.08 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.68 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.51 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  39.01 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  36.15 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  37.08 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.81 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 		 387 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.98 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  36.48 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  34.2 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  35.79 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  36.95 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.82 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 		 373 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  34.29 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  33.84 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  34.99 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  34.73 
 
 		 371 aa  209  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  36.5 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  33.77 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 377 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  33.76 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  32.3 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  31.83 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.82 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.98 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.52 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  30.22 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.01 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>