More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3345 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  80.9 
 
 		 377 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  100 
 
 		 377 aa  777    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  77.19 
 
 		 377 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  41.84 
 
 		 391 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  36.84 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  40.6 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  39.31 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  39.31 
 
 		 390 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  39.31 
 
 		 390 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  39.05 
 
 		 390 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.95 
 
 		 390 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.79 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.68 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  40.63 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  38.95 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  36.31 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  38.73 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.43 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  37.14 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  37.4 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  36.8 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.6 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.5 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.05 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  36.88 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  37.26 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  37.01 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  35.54 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  36.66 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  35.45 
 
 		 383 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.05 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  37.87 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  36.8 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  35.98 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  33.97 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  39.82 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 395 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  33.25 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  35.29 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.02 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 381 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  32.44 
 
 		 376 aa  212  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  36.27 
 
 		 390 aa  212  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.22 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 383 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.96 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.93 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.88 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.94 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  28.65 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.51 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.82 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>