More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1047 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
388 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  72.63 
 
 
390 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  70.98 
 
 
390 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  72.03 
 
 
390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  72.11 
 
 
390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  72.03 
 
 
390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  70.08 
 
 
390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  71.77 
 
 
390 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  70.18 
 
 
390 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  70.08 
 
 
389 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  70.56 
 
 
390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  67.87 
 
 
389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  67.62 
 
 
390 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  67.72 
 
 
390 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  54.22 
 
 
392 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  44.16 
 
 
391 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  39.58 
 
 
377 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  40.1 
 
 
393 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  39.79 
 
 
377 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.52 
 
 
377 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  40.31 
 
 
396 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  37.47 
 
 
394 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  39.39 
 
 
390 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
381 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  39.23 
 
 
387 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.48 
 
 
390 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  39.18 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.96 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 
381 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  37.66 
 
 
378 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 
381 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  36.88 
 
 
385 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  37.34 
 
 
383 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  39.42 
 
 
390 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  39.07 
 
 
395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  38.82 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  37.27 
 
 
394 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 
384 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  37.1 
 
 
389 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  37.47 
 
 
384 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.05 
 
 
391 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.9 
 
 
346 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 
385 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 
387 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 
387 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  36.39 
 
 
380 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
381 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
399 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  35.7 
 
 
373 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  37.37 
 
 
393 aa  225  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 
373 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  34.66 
 
 
377 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 
378 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  36.17 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  34.79 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  34.7 
 
 
396 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  35.28 
 
 
376 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  39.01 
 
 
390 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.81 
 
 
407 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 
382 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 
393 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 
364 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  32 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
378 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
383 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
383 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
381 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.46 
 
 
386 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
377 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
374 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 
382 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
384 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
382 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 
384 aa  106  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 
366 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
384 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
384 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
390 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
380 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.7 
 
 
382 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.99 
 
 
382 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.32 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.05 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
378 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
388 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
370 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
387 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.29 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.29 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>