More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3703 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  96.71 
 
 
395 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  80.76 
 
 
394 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
395 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  77.97 
 
 
390 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.97 
 
 
390 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  74.94 
 
 
393 aa  611  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  78.92 
 
 
346 aa  584  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  65.65 
 
 
396 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  64.75 
 
 
381 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  63.97 
 
 
381 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  63.97 
 
 
381 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  64.12 
 
 
390 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  56.84 
 
 
394 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  55.47 
 
 
383 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  54.95 
 
 
384 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  53.66 
 
 
378 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  53.74 
 
 
381 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  50.39 
 
 
390 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  51.91 
 
 
387 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  50.26 
 
 
378 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  50 
 
 
393 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  50 
 
 
387 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  48.81 
 
 
377 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  48.43 
 
 
373 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  48.04 
 
 
385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  47.64 
 
 
394 aa  359  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  48.53 
 
 
389 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  46.72 
 
 
373 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  49.61 
 
 
391 aa  355  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  45.91 
 
 
376 aa  352  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  46.6 
 
 
396 aa  348  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  45.67 
 
 
380 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  50.39 
 
 
364 aa  345  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.89 
 
 
391 aa  345  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  45.65 
 
 
382 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  46.65 
 
 
385 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  44.99 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.15 
 
 
387 aa  328  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  40.31 
 
 
381 aa  325  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  44.24 
 
 
371 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  46.23 
 
 
384 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  44.39 
 
 
395 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  44.88 
 
 
377 aa  322  9.000000000000001e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  44.79 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  40.51 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 
364 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  39.07 
 
 
388 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38.12 
 
 
389 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  35.26 
 
 
377 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.63 
 
 
377 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 
378 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  41.37 
 
 
407 aa  255  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  38.48 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  36.83 
 
 
389 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.84 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 
390 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.99 
 
 
390 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 
392 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 
390 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  37.7 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  37.7 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  37.96 
 
 
390 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 
390 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 
390 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 
390 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 
385 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 
381 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
390 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.76 
 
 
386 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
381 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
366 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
383 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 
383 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
380 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
380 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
387 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
378 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.2 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  28.1 
 
 
386 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.93 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
397 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
347 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  28.41 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.52 
 
 
382 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
347 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
345 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>