More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2924 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
390 aa  795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  78.46 
 
 
390 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  76.41 
 
 
390 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  76.41 
 
 
390 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  75.38 
 
 
390 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  76.15 
 
 
390 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  76.41 
 
 
390 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  76.41 
 
 
390 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  76.15 
 
 
390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  74.87 
 
 
390 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  70.95 
 
 
389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  69.67 
 
 
389 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  67.72 
 
 
388 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  64.87 
 
 
390 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  56.01 
 
 
392 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  41.21 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  40.32 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 
389 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.52 
 
 
377 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  39.79 
 
 
390 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  41.36 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  39.05 
 
 
377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  39.95 
 
 
396 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.06 
 
 
390 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.47 
 
 
377 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  39.79 
 
 
384 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  40.75 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.52 
 
 
381 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  38.34 
 
 
387 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  39.9 
 
 
394 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  38.78 
 
 
390 aa  249  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  34.47 
 
 
381 aa  249  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 
381 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.7 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  40 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 
394 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.33 
 
 
346 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  37.43 
 
 
395 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  37.7 
 
 
395 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  38.59 
 
 
382 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  39.3 
 
 
373 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 
385 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 
387 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  37.14 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  36.24 
 
 
399 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  38.95 
 
 
394 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  38.03 
 
 
385 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  37.7 
 
 
393 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  38.25 
 
 
381 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  38.18 
 
 
384 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 
378 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  41.21 
 
 
390 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 
396 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 
377 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  37.63 
 
 
371 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  37.14 
 
 
396 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  37.11 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  35.45 
 
 
378 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  36.27 
 
 
377 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  35.39 
 
 
373 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  38.4 
 
 
407 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
364 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 
364 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  35.58 
 
 
378 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
385 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.25 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
382 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.58 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
384 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
381 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
384 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
383 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
383 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
384 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
377 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
374 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.5 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 
384 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  31.4 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  31.4 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.23 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.77 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
347 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
349 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
347 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>