More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7280 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 387 aa  799    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  71.39 
 
 		 385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  58.01 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  55.79 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  54.03 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  54.4 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  55.61 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  51.59 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  50.78 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  50.9 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  47.41 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  48.7 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  48.68 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  48.19 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  48.01 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  47.42 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  47.92 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  46.72 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  47.51 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.24 
 
 		 381 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  44.39 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  46.98 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  46.79 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  45.05 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.66 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  44.96 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  47.92 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  47.67 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  46.77 
 
 		 378 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  43.41 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  46.75 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  45.6 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.44 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  44.88 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  45.05 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  45.55 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  43.86 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  43.01 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  42.82 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  43.39 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  41.78 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  38.34 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  37.53 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  42.26 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  37.92 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  36.43 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.18 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.25 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  34.74 
 
 		 377 aa  246  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.55 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.26 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  35.66 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  35.05 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  35.88 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 		 377 aa  233  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.88 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.92 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  31.03 
 
 		 348 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.11 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 394 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  32.11 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.67 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>