More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3671 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  100 
 
 
383 aa  768    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  95.26 
 
 
384 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  81.08 
 
 
381 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  61.42 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  57.62 
 
 
396 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  54.4 
 
 
394 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  55.91 
 
 
393 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  55.7 
 
 
378 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.64 
 
 
381 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  57.91 
 
 
381 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.33 
 
 
390 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  56.3 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  56.99 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  55.15 
 
 
373 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  61.5 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  55.21 
 
 
395 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  54.4 
 
 
394 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  53.91 
 
 
395 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  54.89 
 
 
346 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  52.11 
 
 
391 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  52.55 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  56.05 
 
 
364 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  48.82 
 
 
385 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  48.81 
 
 
387 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  46.11 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  47.24 
 
 
385 aa  338  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.93 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  47.49 
 
 
373 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  50.26 
 
 
393 aa  328  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  49.08 
 
 
371 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  45.15 
 
 
395 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  46.88 
 
 
384 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  47.72 
 
 
382 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  46.44 
 
 
394 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  46.46 
 
 
389 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  44.59 
 
 
377 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  44.65 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  46.05 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  44.85 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  46.72 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  45.53 
 
 
377 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  41.21 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.85 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  43.56 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  43.86 
 
 
387 aa  295  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  39.63 
 
 
390 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  40.64 
 
 
390 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  39.58 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  39.57 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  40.05 
 
 
390 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  40.05 
 
 
390 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.4 
 
 
389 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  40.21 
 
 
390 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  36.6 
 
 
377 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.34 
 
 
388 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  34.57 
 
 
377 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.14 
 
 
389 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  40.48 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  40.69 
 
 
378 aa  242  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  37.34 
 
 
390 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.45 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  41.39 
 
 
407 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 
390 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.71 
 
 
364 aa  232  9e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  35.79 
 
 
392 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.19 
 
 
386 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
384 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 
382 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 
382 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
374 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
382 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
394 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.54 
 
 
382 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
383 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  36.64 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
384 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
384 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  35.98 
 
 
386 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 
378 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.31 
 
 
369 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.5 
 
 
382 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  33.57 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  35.74 
 
 
378 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>