More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1860 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
394 aa  815    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  60.8 
 
 
393 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  59.73 
 
 
381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  59.09 
 
 
381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  59.09 
 
 
381 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  59.1 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  55.04 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  55.61 
 
 
378 aa  444  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  58.99 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  56.43 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  56.84 
 
 
395 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  54.4 
 
 
383 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  57.11 
 
 
395 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  53.63 
 
 
384 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  55.23 
 
 
381 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.76 
 
 
346 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  57.07 
 
 
390 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  52.22 
 
 
387 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  50.4 
 
 
373 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  48.15 
 
 
394 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  51.34 
 
 
378 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  48.18 
 
 
396 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  46.91 
 
 
395 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  49.73 
 
 
373 aa  358  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  49.34 
 
 
377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  46.24 
 
 
390 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  44.97 
 
 
380 aa  352  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.61 
 
 
391 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  46.17 
 
 
391 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  45.27 
 
 
393 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  46.3 
 
 
387 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  45.95 
 
 
382 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  47.38 
 
 
371 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  46.83 
 
 
376 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  51.06 
 
 
364 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  46.44 
 
 
385 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  46.17 
 
 
399 aa  339  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  44.33 
 
 
396 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  43.98 
 
 
385 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  43.8 
 
 
377 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  44.96 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  43.36 
 
 
389 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  41.47 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  40.94 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  38.83 
 
 
381 aa  298  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.8 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.53 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.23 
 
 
377 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.14 
 
 
389 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.47 
 
 
388 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  38.98 
 
 
378 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.54 
 
 
389 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 
364 aa  250  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  39.55 
 
 
407 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  35.19 
 
 
390 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  35.19 
 
 
390 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 
390 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.01 
 
 
390 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  36.27 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
390 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  34.95 
 
 
390 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  33.95 
 
 
390 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 
392 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 
390 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 
382 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
375 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
385 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.33 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 
366 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
374 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
390 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
384 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
383 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
383 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 
382 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
384 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
384 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  29.78 
 
 
386 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.72 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  29.57 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.65 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  29.48 
 
 
409 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  26.86 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>