More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1194 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
384 aa  800    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  72.77 
 
 
383 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  72.25 
 
 
383 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  71.47 
 
 
380 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  48.95 
 
 
384 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  47.51 
 
 
385 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  48.82 
 
 
381 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  48.03 
 
 
381 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  44.36 
 
 
382 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  44.62 
 
 
382 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  41.75 
 
 
384 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  39.84 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  41.32 
 
 
386 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  40.42 
 
 
374 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  40.05 
 
 
366 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  39.15 
 
 
382 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  36.96 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  38.22 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  37.1 
 
 
390 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.49 
 
 
381 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 
381 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
381 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  29.75 
 
 
394 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
377 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
390 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.22 
 
 
387 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  28.28 
 
 
371 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 
388 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
387 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
377 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
385 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
385 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.32 
 
 
378 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  30.96 
 
 
376 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
390 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.16 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 
387 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.79 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.4 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.18 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
382 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.66 
 
 
391 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.72 
 
 
390 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.16 
 
 
377 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
378 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
371 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
397 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
382 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.68 
 
 
371 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
390 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
387 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.43 
 
 
371 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  30.23 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
387 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
387 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
390 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  28.64 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
388 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
381 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
396 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  26.47 
 
 
396 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 
389 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  30.79 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  25.44 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  27.12 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.35 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  27.11 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.88 
 
 
377 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 
377 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 
394 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
377 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  27.05 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  27.88 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.72 
 
 
382 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>