More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2881 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
388 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  74.81 
 
 
409 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  72.02 
 
 
387 aa  524  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  68.93 
 
 
386 aa  518  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  66.23 
 
 
378 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  64.21 
 
 
397 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  65.24 
 
 
396 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  68.13 
 
 
398 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  64.8 
 
 
409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  63.59 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  65.18 
 
 
413 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  60.36 
 
 
419 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  64.32 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  64.23 
 
 
389 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  56.88 
 
 
378 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  55.58 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  56.54 
 
 
387 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  59.58 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  54.35 
 
 
387 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  58.38 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  55.91 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  51.7 
 
 
385 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  56.44 
 
 
379 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  53.37 
 
 
387 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  47.41 
 
 
396 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  46.45 
 
 
386 aa  328  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  45.91 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  45.64 
 
 
385 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  46.89 
 
 
388 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  47.16 
 
 
378 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  47.34 
 
 
371 aa  311  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  44.79 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  44.99 
 
 
390 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  45.81 
 
 
382 aa  305  8.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  42.64 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  45.88 
 
 
377 aa  290  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  43.83 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  46.48 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  42.82 
 
 
386 aa  252  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 
376 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  35.86 
 
 
378 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  38.72 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  38.56 
 
 
371 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  38.3 
 
 
371 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  36.65 
 
 
376 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  38.12 
 
 
377 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  37.6 
 
 
377 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  35.97 
 
 
394 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  41.53 
 
 
373 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.6 
 
 
377 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  35.6 
 
 
377 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  35.6 
 
 
377 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  39.95 
 
 
373 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
371 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  37.77 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  37.91 
 
 
380 aa  212  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  37.14 
 
 
369 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  36.64 
 
 
395 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  36.2 
 
 
391 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  36.06 
 
 
382 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  36.43 
 
 
396 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  34.68 
 
 
398 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  37.07 
 
 
367 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.57 
 
 
382 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 
388 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
397 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  34.59 
 
 
367 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
381 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 
374 aa  180  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.67 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  39.37 
 
 
372 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
374 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 
393 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
409 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 
366 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
389 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  33.68 
 
 
381 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
385 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
384 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 
349 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 
384 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
384 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 
382 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
390 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  33.74 
 
 
383 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
378 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 
382 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
382 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
383 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
384 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
383 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>