More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4032 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 385 aa  804    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  51.45 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  49.34 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  50.66 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  51.7 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  47.53 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  48.03 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  46.72 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  44.7 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  45.34 
 
 		 396 aa  342  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  45.53 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  45.06 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  45.53 
 
 		 389 aa  329  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  44.85 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  45.89 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  47.04 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  42.41 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  45.21 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  43.9 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  44.5 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  44.71 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  44.5 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  45.05 
 
 		 388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  44.03 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  41.99 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  40.16 
 
 		 378 aa  302  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  41.73 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  42.22 
 
 		 379 aa  296  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  42.11 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  43.65 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  43.16 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  40.83 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  39.79 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  38.2 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.95 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  35.95 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  36.24 
 
 		 388 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  34.48 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  34.68 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  37.83 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 376 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  35.06 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  34.5 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  34.52 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  34.25 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.88 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  33.33 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 391 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.8 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  34.43 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  33.51 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.04 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 381 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>