More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2773 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 391 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  68.6 
 
 		 388 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  64.02 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  62.04 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  49.21 
 
 		 396 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  43.23 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  34.81 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  36.46 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  37.21 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  36.98 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.98 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  37.89 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  36.98 
 
 		 377 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  39.36 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  35.4 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 371 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 385 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  35.71 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  36.86 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  36.2 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  34.57 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  34.66 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  33.25 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  37.7 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  34.29 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  35.32 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  38.32 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.73 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  34.86 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  37.44 
 
 		 409 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  37.92 
 
 		 372 aa  186  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  38.48 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  36.36 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 389 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  31.56 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  34.66 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  36.16 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  34.28 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  32.67 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  33.5 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.04 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  36.29 
 
 		 392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.48 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.06 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 370 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>