More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3328 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  68.95 
 
 		 373 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  54.99 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  52.39 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  52.12 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  52.12 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  45.83 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  46.69 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.69 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  46.69 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  47.62 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  44.48 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  45.68 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  44.75 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  43.14 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  42.94 
 
 		 378 aa  305  7e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  45 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  43.42 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.57 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  39.28 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  38.72 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  40.29 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  38.59 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  43.3 
 
 		 372 aa  245  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  41.88 
 
 		 367 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  39.04 
 
 		 367 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  37.18 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 		 396 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  39.07 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  38.07 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  38.29 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  38.52 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  35.99 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  37.17 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  35.99 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  38.04 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  35.77 
 
 		 397 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  35.93 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  35.99 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  37.4 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  36.96 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  34.89 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.62 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  34.06 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  33.77 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  34.93 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  30.81 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  35.11 
 
 		 397 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 374 aa  152  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 		 409 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 378 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.64 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.06 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.34 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.55 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>