More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2949 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
384 aa  797    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  51.69 
 
 
383 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  51.82 
 
 
383 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  48.95 
 
 
384 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  50.26 
 
 
380 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  46.89 
 
 
385 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  46.49 
 
 
381 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  44.94 
 
 
381 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  45.85 
 
 
384 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  44.42 
 
 
382 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  44.22 
 
 
382 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  39.12 
 
 
377 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  39.95 
 
 
386 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  40.97 
 
 
390 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  38.54 
 
 
374 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  39.15 
 
 
366 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  39.95 
 
 
382 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  38.44 
 
 
394 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
384 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.28 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
377 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
381 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  30 
 
 
393 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.13 
 
 
391 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  29.25 
 
 
394 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 
376 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
382 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
377 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.64 
 
 
378 aa  150  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
384 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.61 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  30.08 
 
 
383 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
396 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 
399 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  28.89 
 
 
371 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
378 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 
388 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 
376 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.9 
 
 
371 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.38 
 
 
369 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.29 
 
 
377 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
377 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  29.29 
 
 
377 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  30.93 
 
 
419 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  33.04 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.64 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.71 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 
394 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 
390 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  28.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
395 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
385 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 
384 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 
396 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  29.8 
 
 
396 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
377 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.33 
 
 
382 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
388 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 
387 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.15 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.47 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 
377 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.24 
 
 
387 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  28.54 
 
 
395 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 
387 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
373 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  28.71 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
391 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
387 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
388 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.79 
 
 
377 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
364 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
386 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
390 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
395 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
359 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
397 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 
390 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>