More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0452 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  100 
 
 
371 aa  740    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  58.65 
 
 
380 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  57.71 
 
 
382 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53 
 
 
391 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  50.93 
 
 
378 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  51.33 
 
 
376 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  48.68 
 
 
396 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  47.38 
 
 
385 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  49.2 
 
 
377 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  51.34 
 
 
378 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  51.32 
 
 
396 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 
390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  52.14 
 
 
381 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  51.88 
 
 
381 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  47.38 
 
 
394 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  47.48 
 
 
393 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.34 
 
 
381 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  48.81 
 
 
394 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.92 
 
 
387 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  49.46 
 
 
373 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  49.61 
 
 
396 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  50 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  48.28 
 
 
391 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  47.76 
 
 
387 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  46.49 
 
 
395 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  47.55 
 
 
377 aa  328  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  48.82 
 
 
384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  51.65 
 
 
381 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  49.08 
 
 
383 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  46.86 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
387 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  47.75 
 
 
390 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.75 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  48.52 
 
 
364 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  44.13 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  45.41 
 
 
385 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  45.5 
 
 
384 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  44.24 
 
 
395 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  43.72 
 
 
395 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  42.08 
 
 
399 aa  294  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  51.2 
 
 
390 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  44.33 
 
 
378 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.95 
 
 
346 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  40.38 
 
 
377 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  40.53 
 
 
381 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.94 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  37.4 
 
 
377 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  40.27 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  38.79 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.5 
 
 
389 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.5 
 
 
389 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 
364 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.84 
 
 
390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.9 
 
 
390 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.92 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.39 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  35.12 
 
 
390 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  34.14 
 
 
390 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 
392 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  34.57 
 
 
390 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  33.78 
 
 
390 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 
390 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
390 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 
390 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 
375 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
381 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
374 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
381 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
383 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  32.64 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
383 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 
380 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 
384 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
382 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
384 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
366 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
384 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
394 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
387 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  30.93 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.27 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 
370 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
378 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
377 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
352 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
377 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
377 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  33.13 
 
 
396 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>