More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2055 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  806    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  70.77 
 
 		 390 aa  587  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  69.49 
 
 		 390 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  69.67 
 
 		 389 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  69.49 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  68.97 
 
 		 390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  68.64 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  70.51 
 
 		 390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  70.51 
 
 		 390 aa  567  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  70.26 
 
 		 390 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  70.26 
 
 		 390 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  69.74 
 
 		 390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  67.62 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  64.87 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  55.24 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  40.63 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  41.78 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.99 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  40.78 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  37.3 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.27 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  37.73 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.73 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  37.08 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.43 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  37.34 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  36.41 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  36.81 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  36.31 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  35.96 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  36.5 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  37.61 
 
 		 381 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  35.36 
 
 		 380 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  36.84 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.08 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 		 394 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  36.41 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 		 378 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  36.62 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  36.05 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  34.46 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.72 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  38.08 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  33.16 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  37.83 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  31.2 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.02 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 381 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.92 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.65 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.23 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.07 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.07 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.4 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>