More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2240 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  81.08 
 
 
383 aa  617  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  79.73 
 
 
384 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  57.22 
 
 
378 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  56.91 
 
 
393 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  59.42 
 
 
387 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  57.03 
 
 
396 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  55.23 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.28 
 
 
381 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  56.01 
 
 
381 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.76 
 
 
390 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  54.92 
 
 
381 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  52.83 
 
 
373 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  56.76 
 
 
390 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  59.95 
 
 
390 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  52.27 
 
 
394 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  53.48 
 
 
395 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  52.41 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  51.72 
 
 
391 aa  352  8.999999999999999e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  54.28 
 
 
346 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  50.8 
 
 
390 aa  348  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 
385 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  49.33 
 
 
394 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  54.57 
 
 
364 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  51.65 
 
 
371 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  47.38 
 
 
380 aa  325  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  45.41 
 
 
399 aa  325  7e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  49.47 
 
 
393 aa  324  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  47.58 
 
 
387 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  46.01 
 
 
384 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  46.13 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  47.3 
 
 
373 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  47.04 
 
 
393 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  43.27 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  44.65 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  45.72 
 
 
389 aa  312  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  45.16 
 
 
377 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  43.73 
 
 
396 aa  308  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  46.07 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  43.51 
 
 
376 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  41.55 
 
 
381 aa  298  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.09 
 
 
391 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  42.71 
 
 
396 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  43.04 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  42.7 
 
 
377 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  40.31 
 
 
378 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.39 
 
 
377 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.66 
 
 
377 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  38.42 
 
 
389 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  38.54 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.51 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  38.81 
 
 
390 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  38.81 
 
 
390 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  38.98 
 
 
390 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36.63 
 
 
388 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  37.61 
 
 
390 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  38.27 
 
 
390 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
390 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 
390 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  36 
 
 
389 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  37.6 
 
 
390 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  40.67 
 
 
407 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 
364 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.98 
 
 
390 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  34.76 
 
 
392 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 
390 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.68 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.88 
 
 
382 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.54 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 
385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
384 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
381 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.04 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
374 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 
378 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
383 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
390 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 
382 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.13 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.62 
 
 
386 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
394 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
384 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  33.82 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  36.06 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 
377 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.89 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  34.48 
 
 
396 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  32.29 
 
 
367 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>