More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1634 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 378 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  43.26 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  45.21 
 
 		 380 aa  325  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  46.98 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  45.74 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  44.26 
 
 		 377 aa  319  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.2 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  42.7 
 
 		 377 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  42.18 
 
 		 390 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  42.28 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  42.28 
 
 		 376 aa  308  6.999999999999999e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  40.47 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  42.37 
 
 		 394 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  44.21 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  41.78 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  42.36 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  41.49 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  43.2 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  37.96 
 
 		 399 aa  275  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  39.9 
 
 		 393 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  38.4 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.74 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  42.74 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  39.89 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  43.01 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  41.4 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  42.06 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  40.31 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  40.16 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 373 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  40.73 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  40.69 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  43.12 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.11 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  39.01 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  39.06 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  39.32 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  37.47 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.07 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  43.39 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.68 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.2 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.2 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  35.42 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  34.7 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  34.19 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  34.19 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.73 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.03 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  33.79 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.02 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  35.6 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 382 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.03 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  30.91 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  29.19 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  30.87 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.69 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.1 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.85 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  32.03 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>