More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0966 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  95.26 
 
 		 383 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 384 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  79.73 
 
 		 381 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  59.84 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  57.55 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  55.26 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  53.63 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  55.32 
 
 		 378 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.78 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  57.26 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  57.1 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.84 
 
 		 381 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  54.62 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  55.5 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  60.7 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  54.69 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  53.63 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  53.39 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  55.46 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  51.6 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  50.53 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  48.56 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  48.56 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  54.59 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.4 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  45.93 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  47.23 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  49.47 
 
 		 393 aa  329  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  46.7 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  44.5 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  48.82 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  46.32 
 
 		 389 aa  326  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  46.35 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  44.73 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  46.92 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  44.47 
 
 		 377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  45.93 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  45.17 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  43.86 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  44.76 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  43.8 
 
 		 376 aa  312  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.85 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  43.38 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  40.94 
 
 		 381 aa  305  8.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  42.82 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  40.32 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  38.52 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.26 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  38.73 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  38.73 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.2 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  39.41 
 
 		 390 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.53 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.6 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  34.31 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  36.87 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  40.16 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 		 377 aa  245  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.71 
 
 		 377 aa  245  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.81 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  40.83 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  33.93 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.55 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.11 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.31 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.2 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  33 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 377 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.92 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  30.71 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>