More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1734 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 390 aa  802    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  60.82 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  59.79 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  56.25 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  53.39 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  58.85 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  56.25 
 
 		 378 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  54.93 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  54.83 
 
 		 385 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  54.23 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  53.76 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  51.06 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.76 
 
 		 391 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  53.16 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  51.59 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  53.7 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  51.04 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  51.19 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  49.6 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  52.55 
 
 		 383 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  49.34 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  49.61 
 
 		 391 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.34 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  50.39 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  50.39 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.74 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  51.6 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.48 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 		 390 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.24 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  48.43 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  49.87 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  48.55 
 
 		 373 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  48.67 
 
 		 396 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  50.8 
 
 		 381 aa  348  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  48.23 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  53.17 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.84 
 
 		 346 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  42.37 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  43.6 
 
 		 384 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  45.14 
 
 		 364 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.18 
 
 		 378 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  39.11 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  42.59 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  43.82 
 
 		 393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  39.48 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  39.64 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  42.62 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.86 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  39.9 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  39.9 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  39.9 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.92 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.36 
 
 		 377 aa  262  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  39.12 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  39.38 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.86 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.99 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  39.39 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.88 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.39 
 
 		 392 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.39 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.21 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.28 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.89 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  31.83 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>