More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0392 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 394 aa  802    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  66.14 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  65.54 
 
 		 393 aa  497  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  59.79 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  59.15 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  54.4 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  56.8 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  50.26 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  49.21 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  53.53 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.91 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  49.87 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  50.66 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  51.16 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  52.25 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  52.23 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  49.06 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.12 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  47.37 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.2 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  50.93 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  51.46 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  49.08 
 
 		 387 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  50.67 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  49.48 
 
 		 394 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  49.34 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  49.07 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  48.14 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  47.64 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  47.91 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  46.7 
 
 		 396 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.87 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  49.6 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  49.33 
 
 		 381 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  47.37 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  45.89 
 
 		 373 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  47.11 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  45.85 
 
 		 391 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  49.74 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.37 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  44.47 
 
 		 384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.37 
 
 		 378 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.89 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  43.16 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  37.96 
 
 		 377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  40.21 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.63 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.27 
 
 		 388 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  38.06 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  37.53 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  36.81 
 
 		 390 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  37.53 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  37.53 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  37.53 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.76 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  37.3 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.08 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.92 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.58 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.65 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 381 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  33.06 
 
 		 390 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.19 
 
 		 369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.21 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.09 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.6 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  29.64 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.03 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>